Es frecuente encontrar todo tipo de información relacionada con los beneficios y ventajas del empleo de una plataforma de capacitación virtual o LMS, sin embargo, como todo sistema informático, estas plataformas tienen limitaciones que es importante conocer cuando se piensa iniciar un proceso de capacitación basado en estas.
A continuación algunos puntos a tener en cuenta específicamente en Moodle.
1. Pueden ser limitadas o no estar disponibles algunas herramientas pedagógicas muy utilizadas en procesos educativos, como por ejemplo: Crucigramas, Juegos de Roles (role playing), rompecabezas, etc.
2. La imposibilidad de realizar una óptima gestión económica – financiera de alumnos (control de pagos, por ejemplo) también en línea, sobre todo cuando un mismo alumno está inscrito en varios cursos.
3. Limitaciones en la segmentación de contenidos por alumnos. Es decir, no es sencillo ir acompañando el proceso de aprendizaje de cada alumno independientemente, mostrándole sólo las lecciones, actividades, etc., que más se adecuen a su perfil y desempeño.
Ese perfil se determina según criterios de evaluación definidos por el docente y el historial de desempeño del alumno. Esto es necesario porque se considera que los procesos de aprendizaje varían en función de las capacidades de cada alumno. Por ejemplo: un alumno con un buen desempeño seguramente requerirá de un proceso de aprendizaje diferente de aquel que tiene un perfil bajo. Por lo tanto, los contenidos a utilizar por uno deberían ser diferentes de los utilizados por el otro.
4. Al no existir presencia directa de docentes es fundamental que existan herramienta adecuadas y con óptimo funcionamiento para la comunicación y colaboración constante.
5. Por estar basado en tecnología PHP, la configuración de un servidor con muchos usuarios debe ser cuidadosa para obtener el mejor desempeño, cabe señalar que también hay ciertas desventajas asociadas a la seguridad, dependiendo en dónde se esté alojando la instalación de Moodle, y cuáles sean las políticas de seguridad y la infraestructura tecnológica con la cual se cuente durante la instalación.